颜色和光泽的差异
数码打样是通过电子设备将图像转换成实际可以触摸的物体，它在处理颜色的过程中，往往会使用一种特殊的算法来模拟不同类型纸张上色彩的效果。然而，这种模拟并不能完全复制真实世界中的光线、反射和吸收现象。在实际印刷时，由于不同的纸张质地、涂层厚度以及灯光照射角度等因素，颜色可能会显得更深或更浅，并且有时候还会出现明显偏绿或者偏紫的情况。
纸质感受力的差异
数码打样的结果通常是在平坦的屏幕上观看，因此我们很难真正感受到纸张上的纹理和质感。而当这些设计被送到印刷机器上进行物理加工时，纸张本身就带有独特的地形，如纤维方向、粗糙程度等，这些都影响了最终产品的手感。如果没有精确控制这些细节，即使最完美的设计也可能因为不匹配的手感而失去了一部分用户体验。
色准与对比度的问题
虽然现代数码打样技术已经非常先进，但它仍然无法完全克服色准问题。在高对比度区域，比如黑白切换处，数码打样的表现往往优于实际印刷。但是，在渐变区域或者需要精确调校颜色的场合，两者之间还是存在一定差距。例如，一些专业图片编辑软件能实现非常细腻的人工调整，而这在传统印刷过程中则很难达到同样的效果。
打字排版质量差异
对于文字内容来说，最常见的一个问题就是字迹粗细不一致。这通常是由于分辨率不足或具体字号设置不当导致。当文本被放大或缩小到某个特定的尺寸时，不同大小字母间距离就会变得明显，对读者的视觉舒适性造成影响。此外，有些专业级别的大型书籍出版商甚至会专门为自己的作品定制新的排版系统，以保证每一个字符都是最佳状态下的显示。
亮度和深墨沉着的问题
在一些情况下，比如创意艺术品或者商务宣传册，我们希望获得极其鲜艳或深沉的颜色。但即便最新一代喷墨机器也难以达到数字画板上的那种鲜艳程度，因为它们工作的是物理原理，而不是像电子屏幕那样通过电荷控制光线。相反，当试图用较低分辨率来创建超暗背景时，也容易引起笔记本电脑显示器上看起来良好的阴影效果却无法在正式出版物中成功重现。
数位文件格式转化挑战
最后一个挑战来自于原始文件格式转化为可用于工业生产的一种格式。许多设计师习惯于使用PSD这样的矢量图形工具，但事实上这并不直接支持所有类型的输出要求。而为了让相同设计能够从A4单页扩展到巨大的海报，或从标准版面拓展至全息广告板，都需要额外操作以适应不同的应用场景，这无疑增加了时间成本并可能导致误解产生错误版本。
