烹饪方式不同
电烤箱通过热风或电磁波来加热食物，实现均匀的温控和烘焙效果。而微波炉利用非离子化能量（即微波）直接在食物内部产生热量，使得加热速度快，但控制难度大。
加热效率与安全性
由于电烤箱采用传统加热方式，加热时间较长，且需要注意温度控制。相反，微波炉的加热效率高，可以快速煮熟食物，但易出现过火或不均匀加熱的情况，因此使用时需谨慎设置功率和时间。
食物保鲜性能
电烤箱因其开放式结构，对于湿润食品如蔬菜、水果等进行预处理后再放入内胆可以保持更好的新鲜度。相对而言，微波炉由于封闭式设计，在短期内使用可以有效地保留营养素，但长时间存储会导致维生素C等水溶性维生素流失。
功能与便捷性
现代电子制冷型电烤箱功能全面，如自动定时、多种预设程序、智能感温器等，为用户提供了更加方便舒适的操作体验。而尽管一些高级型号的微波炉也具备诸多先进功能，但整体上它仍然以简单易用著称，不像电烤箱那样复杂繁琐。
营养价值影响
研究表明，由于不同的加热方式对营养成分有所影响。在某些情况下，比如蒸汽炖煮，这两种设备都可能无法达到最佳效果。此外，一些特定的食材，如蛋白质丰富的肉类，在经历了长时间慢火烧制之后，其口感和营养吸收都有可能得到改善，而这在普通家庭中通常是由传统燃气或煤炭灶进行实现。
